一般情況下，做完氣管鏡咳嗽得很厲害可能是氣管黏膜損傷、食物刺激、細菌感染等原因引起的。具體分析如下：
1.氣管黏膜損傷：通常人體的氣管黏膜比較薄，做氣管鏡可能會損傷氣管黏膜，從而出現做完氣管鏡咳嗽得很厲害的情況。建議患者平時注意休息，不要熬夜，多喝水，同時在醫生的指導下服用阿莫西林片、氫溴酸右美沙芬片、那可丁片等藥物進行治療。
2.食物刺激：做完氣管鏡，如果患者吃了辛辣、刺激的食物，可能會刺激氣管黏膜，從而出現做完氣管鏡咳嗽得很厲害的情況。建議患者平時少吃辛辣、刺激的食物，同時在醫生的指導下霧化吸入藥物進行治療，常用藥物有硫酸特布他林、布地奈德、酒石酸左沙丁胺醇等。
3.細菌感染：做完氣管鏡，如果細菌感染氣管，可能會導致氣管黏膜發生炎癥反應，從而出現做完氣管鏡咳嗽得很厲害的情況。患者要及時去醫院就診，然后靜脈注射頭孢氨芐、青霉素鈉、頭孢美唑鈉等藥物進行治療，同時要帶好口罩，以免加重病情。