咳嗽肩膀后背疼痛可能是普通感冒、支氣管炎、胸膜炎、頸椎病、肩關節周圍炎等因素所致，建議患者及時前往正規醫院就診檢查，在醫生的指導下選擇日常護理、藥物治療的方式進行處理。
1、普通感冒：普通感冒通常是由病毒感染引起。病毒侵襲人體后，會引起全身的免疫反應，可能導致肌肉酸痛，包括肩膀后背疼痛，同時伴有咳嗽等癥狀，伴隨癥狀可能有流鼻涕、發熱、乏力等。患者可以在醫生的指導下服用復方氨酚烷胺片、氨咖黃敏膠囊、雙黃連口服液等藥物進行治療。
2、支氣管炎：支氣管炎一般由病毒、細菌感染或物理、化學刺激等因素引起。炎癥刺激支氣管黏膜，引發咳嗽，同時可能牽涉到周圍組織引起肩膀后背疼痛，伴隨癥狀可能有咳痰、喘息、胸悶等。患者可以在醫生的指導下服用鹽酸氨溴索片、復方甘草合劑、阿莫西林膠囊等藥物進行治療。
3、胸膜炎：胸膜炎是由于感染、自身免疫性疾病等原因引起的胸膜炎癥。炎癥刺激胸膜，會導致胸痛，疼痛可放射至肩膀后背，同時伴有咳嗽，伴隨癥狀可能有發熱、呼吸困難等。患者可以在醫生的指導下使用注射用頭孢曲松鈉、阿莫西林膠囊、阿奇霉素片等藥物進行抗感染治療。
4、頸椎病：頸椎病主要是由于頸椎長期勞損、骨質增生癥等原因導致頸椎脊髓、神經根或椎動脈受壓迫。當頸椎病發作時，可能會引起上肢放射性疼痛，有時會牽涉到肩膀后背，同時可能刺激呼吸道引起咳嗽，伴隨癥狀可能有上肢麻木、無力等。患者可以在醫生的指導下服用頸復康顆粒、甲鈷胺片、布洛芬緩釋膠囊等藥物進行治療。
5、肩關節周圍炎：肩關節周圍炎主要是由于肩部軟組織退行性病變、長期過度活動等原因引起。肩部疼痛會放射至后背，有時咳嗽時疼痛會加重，伴隨癥狀可能有肩關節活動受限、肌肉萎縮等。患者可以在醫生的指導下服用雙氯芬酸鈉緩釋片、美洛昔康片、活血止痛膠囊等藥物進行治療。
患者在患病期間應注意休息，避免過度勞累和劇烈運動；注意保暖，避免受寒；保持良好的姿勢，避免長時間低頭或彎腰；飲食宜清淡，多吃富含營養的食物，增強身體抵抗力。