懷孕40天的女性如果選擇藥物流產，很多人會擔心藥物是否能夠將妊娠組織完全排出體外。這是因為在藥物流產過程中，子宮需要通過收縮來排出宮內組織，但有時候可能會有殘留。
一般來說，藥物流產的成功率在80%到90%之間。這意味著大部分情況下，藥物可以有效促使子宮收縮，從而將胚胎和胎盤組織排出。然而，由于個體差異、妊娠時間以及子宮情況的不同，仍然有一部分人會出現不完全流產的情況。
如果藥物流產后出現持續性陰道流血、腹痛加劇或發熱等癥狀，建議及時就醫檢查。醫生可能會通過超聲波檢查來確認宮腔內是否有殘留組織，并根據具體情況決定是否需要清宮手術。
需要注意的是，藥物流產只能在懷孕早期（通常為49天以內）使用，且必須在專業醫師指導下進行。藥物本身有一定的風險性，可能導致大出血或其他并發癥，因此不建議擅自用藥。
總結來說，雖然大部分情況下藥物流產可以排干凈，但為了確保安全，建議在醫生的指導下完成整個流產過程，并嚴格按照醫囑進行后續隨訪。