患者牙齒存在牙菌斑癥狀時，可能會影響美觀，還會引發齲病、牙周疾病等危害。需要及早在醫生指導下進行牙菌斑去除治療，若存在其他疾病時也需要積極治療其他疾病。
1、影響美觀：由于牙菌斑主要附著在牙齒表面，在牙齒表面形成較為堅硬的結石，進而會影響患者美觀；
2、引發齲病：多見于齦上菌斑，主要分布在近牙齦1/3、牙冠處和牙上其他不易清潔的窩溝裂隙臨界面等部位，革蘭氏陽性球菌占優勢，與齲病發生、齦上牙石等疾病形成有關，齦緣附近的齦上菌斑還會危害牙周組織；
3、引發牙周疾病：齦緣以下附著于牙根面的齦下菌斑稱為附著性齦下菌斑，由齦上菌斑延伸到牙周袋內，結構成分與齦上菌斑相似，細菌種類增多，主要為革蘭氏陽性球菌與桿菌、絲狀菌，還可見少量革蘭氏陰性短桿菌和螺旋體等，與齦下牙石形成、根面齲、根面吸收及牙周炎有關。而牙齦非附著性菌斑，牙齦緣以下位于附著性齦下菌斑表面或直接位于齦溝上皮、袋內上皮接觸的齦下菌斑，為結構較松散的菌群，主要為革蘭氏陰性厭氧菌，如牙齦卟啉單胞菌、核梭桿菌、福賽坦菌等，還包括許多冷凍細菌和螺旋體，在牙周炎快速進展時非附著性齦下菌斑明顯增多，毒力增強，與牙槽骨的快速吸收破壞有關，也與牙周炎發生發展較為密切。
此外，由于牙菌斑細菌數量增多時，可能還會導致細菌侵襲其他部位，出現口臭、咽喉炎等疾病，因此建議患者盡早進行牙菌斑去除，如齦上或齦下潔治術等方式緩解。