子宮內膜變薄有多種可能的原因，有些情況下是可以恢復的，而有些情況下則無法恢復，因此需要采取不同的治療措施。子宮內膜變得更薄，主要有兩種可能的原因，其中一種是由于器質性疾病，這與宮腔手術中的內膜損傷有關。其中一種是由內分泌相關疾病引發的。在這兩類病因中，前者比較多見，后者較少發生。器質性的疾病在臨床上恢復起來相對困難，但由于內分泌相關的疾病，藥物治療在大多數情況下能夠帶來恢復。
1、器質性疾病：子宮內膜會變得較薄。如果近期有宮腔手術的歷史，如刮宮或人工流產術，這些手術可能會對子宮內膜的基底層造成損傷，從而使子宮內膜再生變得困難，進一步導致內膜變薄和月經量減少。通常情況下，需要進行雌孕激素的周期性替代治療，以增加子宮內膜的厚度，雖然在某些情況下有恢復的可能，但在其他情況下恢復起來相當困難。如果恢復困難，還需要進一步進行宮腔鏡檢查，以排除宮腔粘連的可能性。當宮腔發生粘連時，治療的難度會增加，經常需要在宮腔鏡下進行粘連的松解，但疾病往往會再次出現。
2、內分泌相關疾病：需要對患者進行性激素六項檢查和甲狀腺功能檢查，這些通常與高泌乳素血癥、甲狀腺功能異常、卵巢早衰等特定疾病有關。這類疾病可能會對卵巢的排卵過程產生干擾，從而導致雌孕激素水平下降。在某些情況下，這可能會使子宮內膜變得更薄。藥物治療通常能夠幫助恢復子宮內膜的厚度。
另外，需要特別指出的是，如果月經剛剛結束，檢查結果顯示子宮內膜變得較薄，這可能是生理原因造成的，不需要特別的處理，隨著體內激素水平的變化，會逐步恢復到正常狀態。