墨魚蛋是一種具有較高營養價值的食材，不能吃墨魚蛋的人群通常有對墨魚蛋過敏者、高脂血癥患者，以及手術后患者。同時，日常應避免盲目過量食用墨魚蛋，以免出現不良后果，影響身體健康。
1、對墨魚蛋過敏者：若對墨魚蛋過敏的人群食用了墨魚蛋后，會引起機體防御機制啟動，并引起過敏反應出現，如出現皮疹、瘙癢、胸悶等癥狀，嚴重時甚至會有呼吸困難。若此類人群誤食墨魚蛋，可在醫生的指導下服用氯雷他定片等抗組胺藥物緩解；
2、高脂血癥患者：墨魚蛋屬于一種高熱量的海鮮食物，通常含有較多的膽固醇，而高脂血癥的患者本身由于體內膽固醇偏高，導致動脈血管壁硬化、增厚，因此高脂血癥患者進食墨魚蛋，可能會加重病情，甚至誘發心腦血管的疾病；
3、手術后患者：手術后的患者通常會有創口，而墨魚蛋是海鮮類食品，含有異體蛋白，可能會誘發創口的感染，導致創口難以愈合，甚至出現創口潰爛，故此類人群也應盡量減少或避免攝入。
即使是正常體質的人群也應當適量食用墨魚蛋，過量食用可能會加重胃腸道的消化負擔，出現腹脹、腹痛、便秘等不適癥狀。若攝入墨魚蛋后出現上述不適，應當及時去醫院就醫。