子宮內膜薄中醫通常診斷為月經過少，為月經量明顯減少，或行經時間不足2天，甚或點滴即凈者，連續出現2個月經周期以上。需要根據月經過少的分型遵醫囑進行治療，如腎虛證使用歸腎丸，血虛證使用滋血湯，血瘀證使用桃紅四物湯，痰濕證使用蒼附導痰丸。
1、腎虛證：經量素少或漸少，色暗淡，質稀，伴有腰膝酸軟、頭暈耳鳴、小腹冷舌淡、脈沉弱等病癥，主要由于腎氣虧虛、精血不足引起。需要在醫生指導下使用歸腎丸治療，由菟絲子、杜仲、枸杞、山茱萸、當歸、熟地黃、山藥、茯苓組成，具有補腎益精、養血調經的作用；
2、血虛證：經來血量減少，或點滴即凈色淡，質稀，伴小腹隱痛、頭暈眼花、心悸怔忡、面色萎黃、舌淡紅、脈細等病癥，主要由于氣虛血少、沖任血海不盈導致。需要在醫生指導下使用滋血湯治療，中藥方為人參、山藥、黃芪、茯苓、川芎、當歸、白芍、熟地黃，具有養血、益氣、調經的作用；
3、血瘀證：主要證候為經行澀少，色紫暗，有血塊，小腹脹痛，血塊排出后脹痛減輕，舌紫暗，或有瘀斑、瘀點，脈沉弦或沉澀，由于瘀血內停、沖任阻滯導致。需要遵醫囑使用桃紅四物湯治療，包括桃仁、紅花、當歸、熟地黃、白芍、川芎等藥物，具有活血化瘀、調經的作用；
4、痰濕證：主要證候為經行量少，色淡紅，質黏膩如痰，伴有形體肥胖、胸悶嘔惡，或帶多黏膩、舌淡、苔白膩、脈滑等病癥，由于痰濕內停、阻滯經絡、氣血運行不暢導致。需要遵醫囑使用蒼附導痰丸治療，包括蒼術、香附、陳皮等藥物，具有化痰燥濕、調經的作用。
除了以上藥物外，還可以遵醫囑使用逍遙丸、烏雞白鳳丸等藥物進行治療。建議患者遵醫囑用藥，不可自行用藥，用藥期間飲食宜清淡，避免進食辛辣刺激性食物，以免影響藥效。