毛發紅糠疹的病因尚不明確，可能與遺傳因素、維生素A缺乏、內分泌失調、角化功能障礙、過敏等因素有關，其是指一組以局限性毛囊角化、掌跖角化病和紅皮病為特征的慢性皮膚病。
1、遺傳因素：毛發紅糠疹的大多數患者為常染色體顯性遺傳，或為隱性遺傳，因此如果家屬有毛發紅糠疹，其子女患有毛發紅糠疹的概率比較大。
2、維生素A缺乏：維生素A對皮膚具有一定的作用，如促進皮膚的新陳代謝、保護皮膚等，如果缺乏維生素A可導致多種皮膚病，也可能會引起毛發紅糠疹。
3、內分泌失調：內分泌失調主要表現為體內激素水平的不穩定，如體內雄激素增多，從而引起毛發紅糠疹。
4、角化功能障礙：當皮膚出現角化功能障礙時，就會導致機體防御機能降低，易通過黏膜途徑而感染疾病，引起毛發紅糠疹。
5、過敏：如果皮膚接觸到過敏原，如花粉、塵螨等，就可能會引起過敏反應，出現瘙癢、起紅斑、丘疹、水皰等癥狀。
除以上因素外，毛發紅糠疹還可能與感染、甲狀腺功能減退、下丘腦-垂體-腎上腺軸功能障礙、肝病、卡波西肉瘤、腸癌等因素有關。毛發紅糠疹的患者可以在醫生指導下使用咪喹莫特乳膏、維A酸乳膏等藥物進行治療，同時需注意避免搔抓皮膚。