CT薄層掃描和CT平掃的區別在于掃描厚層以及適用范圍不同，具體內容如下：
CT薄層掃描的掃描厚層≤5mm，CT平掃的掃描厚層大概在5mm-10mm，CT薄層掃描常用于較小結構病灶的觀察，CT平掃又稱普通掃描，是指靜脈內不給含碘造影劑的掃描，常用于初次采用CT檢查的患者。CT薄層掃描可以更好地發現微小的病灶，觀察病灶細微的特點，從而更有利于疾病的診斷，一般可以觀察微小結節或者微小結節病變中的細節問題，如邊緣、密度、與周圍關系、有沒有脂肪密度、有沒有鈣化影子等，能夠有效地幫助醫生診斷病因。CT平掃是放射科最常規的檢查手段，常用于疾病的初次診斷，但是CT平掃無法發現微小病變或者微小結節病變中的細節問題。