一般情況下，頭顱CT基底節區的位置是在大腦的側腦室兩旁。
基底節區是基底神經節的位置，通常位于大腦的側腦室兩旁，是大腦的中心灰質核團，包括杏仁核、紋狀體和屏狀核。主要參與運動的啟動和執行，且該部位也是易出血的部位。如果患者的基底節區受到傷害，就會導致運動神經損傷，進而導致四肢僵硬、行動困難等癥狀。一般在進行CT檢查的時候，可以判斷該部位有無出血情況，有無神經異常現象，以此來判斷患者的具體情況。
當出現了異常后，如出血，需及時接受治療，可以遵醫囑使用七十味珍珠丸、清腦復神液等藥物來緩解頭暈、頭痛等現象。還可以使用甲鈷胺片進行營養神經，也可以使用甘露醇注射液降低壓力，阿司匹林片進行抗血小板凝集治療。