小兒心房顫動是一種罕見的疾病。主要發生的原因有法洛氏四聯癥，法洛氏三聯癥，法洛氏五聯癥，房間隔缺損，室間隔缺損等有關，在心房增大的情況下，很有可能與房顫同時出現；其次，患兒的植物神經機能障礙也會引起房顫；在肥胖癥的孩子中，經常會有呼吸睡眠障礙或呼嚕，也容易合并陣發性房顫的發生。甲狀腺功能亢進或減退、其他的心律失常、小兒腹瀉引起電解質紊亂等均可以誘發房顫。