多潘立酮和阿莫西林最好分開服用，不建議一起吃。
多潘立酮是一種胃腸動力藥，常用劑型有片劑、膠囊劑、口服液體制劑，主要用于消化不良、腹脹、噯氣、惡心、嘔吐、腹部脹痛，作用于胃腸壁，能夠促進胃腸動力，促進胃排空，一般需要在飯前半小時服用。
阿莫西林為β內酰胺類抗生素、青霉素類藥，常用劑型有片劑、膠囊劑、顆粒劑、咀嚼片等，主要用于呼吸道感染、泌尿生殖道感染、皮膚軟組織感染、急性單純性淋病、傷寒、鉤端螺旋體病等病癥，對胃腸道有一定的刺激性。所以一般建議患者在飯后吃。因此，患者在服用兩種藥物時，需要分開服用。一起吃可能還會影響各自的效果，發生拮抗反應。
需要注意的是，服用多潘立酮后可能會出現口干、神經過敏、頭痛、嗜睡、失眠、腹瀉、反流、惡心、頭暈、倦怠、腹部痙攣、胃灼熱感等癥狀。服用阿莫西林后還可能有惡心、嘔吐、腹瀉及假膜性腸炎等胃腸道反應，所以患者用藥一定要經過醫生的診斷，在醫生指導下，嚴格遵醫囑服用。
綜上所述，多潘立酮和阿莫西林通常不可以一起吃，建議在醫生的指導下進行，不可盲目使用。若發生不良反應，需要及時前往消化內科就診。