病理癌基因蛋白檢測主要是從患者病灶部位提取組織進行切片檢查，可觀察組織內癌細胞、癌基因蛋白的表達情況，從而確定腫瘤類型、預后效果等。
病理癌基因蛋白檢測是臨床上針對癌癥患者的一種檢測方式，也是對治療具有重要意義的一項檢查，包括單克隆抗體檢測、特殊染色及酶組織化學等方面。需將病灶部位提取的病理組織切片通過免疫組織化學染色法、熒光原位雜交法等進行檢測，了解癌細胞對癌基因蛋白的表達情況，從而確定腫瘤分子類型、預后效果等，以幫助醫生更好地確定后續治療方案。尤其在選擇靶向治療藥物方面，作用較為突出，能夠大幅提高癌癥治療效率以及成功率。
臨床較為常用的病理癌基因蛋白檢測方法是免疫組織化學染色法，可通過抗原抗體產生的特異性反應，來確定腫瘤細胞表達。而熒光原位雜交法則是通過DNA堿基配對的方式，幫助了解mRNA表達，準確性和特異性相對較好，但價格相對昂貴。