月經第三天黑色可能是月經沒有及時排出、血流速度減慢、內分泌紊亂、宮腔粘連、缺鐵性貧血等原因導致的，患者需要及時到醫院就診，并且配合醫生對癥治療。
1、月經不能按時排出：一般的月經是鮮紅色的，如果血液離開了血管，在身體里停留的時間就會變得更深，到了月經的第三天，經期就會變得很少，不能及時把身體從身體里排出來，可能會變成黑色。這通常是正常現象，不需要特殊處理。
2、血流速度減慢：來月經時，因為運動太少，血液中的鐵元素會發生氧化沉淀，從而引起月經顏色的改變。來月經的時候可以多做一些運動，比如散步、慢跑等。
3、內分泌紊亂：長期熬夜、作息不規律、精神壓力過大等都有可能造成內分泌紊亂，使月經量減少，呈現黑色的經血，同時還會伴有痛經、易疲勞等表現。要有一個好的生活習慣，不能熬夜，要有一個好的心態。
4、宮腔粘連：當有宮腔粘連時，就會有大量的經血堆積在宮腔內，很難將其排出，經期的血液會慢慢變成褐色或者咖啡色，然后在來月經的第三天變成黑色。可以在醫生的指導下服用益母草顆粒、烏雞白鳳丸等。
5、缺鐵性貧血：人體內缺少鐵元素會造成缺鐵性貧血，貧血的癥狀是血液的顏色呈黑色，同時還會有月經期縮短、月經推遲等癥狀。平時可以多吃一些含有鐵的食物，如豬肝、牛肉等，還可以在醫生的指導下服用硫酸亞鐵片、富馬酸亞鐵片等。
患者需要多休息，盡量保持良好的情緒，還需要注意私處的清潔。