芽生孢子是真菌的一種生長階段，芽生孢子陽性提示機體有真菌感染，需要根據患者臨床表現進行抗真菌治療，常見的治療方式有一般治療、藥物治療等。
1、一般治療：芽生孢子陽性的患者應該多吃富含蛋白質的食物，如雞蛋、瘦肉、乳制品等，以增加機體營養，促進真菌感染快速恢復，還要忌食辛辣、刺激的食物。平時還要注意個人衛生，保持皮膚清潔、干燥，可每天用溫水淋浴，使用溫和的沐浴用品洗澡，減少對皮膚的刺激。治療期間保證充足的睡眠，避免過度勞累，還要適當進行運動鍛煉增強體質；
2、藥物治療：需要根據患者的感染部位和感染方式，以及患者的免疫狀況，選擇敏感的抗真菌藥物進行治療，可選擇唑類抗菌藥物局部用藥或全身用藥，如氟康唑膠囊、伏立康唑片、伊曲康唑膠囊等，此外還可選擇多烯類藥物，如注射用兩性霉素B脂質體，也可以選擇棘白菌素類抗真菌藥物，如注射用醋酸卡泊芬凈、注射用米卡芬凈鈉等進行治療。局部用藥主要用于皮膚和黏膜真菌感染，可以用制霉菌素軟膏、洗劑、陰道栓劑等，可以起到一定的治療效果。