懷孕三個月肚子上有小紅點可能是正常現象，也可能是發生了過敏反應、濕疹，具體分析如下：
1.正常現象：懷孕三個月時，患者的激素分泌會明顯增多，就可能會導致患者的肚子上出現小紅點，如果不存在疼痛或者瘙癢的情況，可以不用特殊處理，適當觀察即可。
2.過敏反應：如果患者在懷孕三個月的時候接觸了花粉、塵螨、動物皮屑等過敏原，也可能會導致患者的肚子上出現小紅點，一般還會伴有瘙癢的情況，建議遵醫囑使用尿素乳膏、爐甘石洗劑等藥物進行緩解。
3.濕疹：肚子上出現小紅點也可能是濕疹造成，可以遵醫囑使用復方地塞米松乳膏、氧化鋅軟膏等藥物進行治療。
除此之外，蟲咬皮炎也會導致患者出現上述癥狀，建議及時就醫，明確病因后采取對應措施進行治療。