C肽從某種意義上可以反映內源性胰島素分泌的能力，如果C肽偏低，說明體內胰島B細胞功能偏弱，反映患者本身胰島功能偏低，以及內源性胰島素分泌功能不足，并且在胰島素生成、代謝的過程中內源性C肽偏低，也反映出患者的胰腺功能比較差。
胰島素在體內發揮作用時，要通過肝臟經過門脈系統降解，分離之后變成胰島素分子和C肽，胰島素C肽的主要功能是反映胰島素分泌的水平。因此在臨床上，也會通過檢測C肽了解內源性胰島素的分泌情況，以此評估患者的病情。此外，C肽還具有一定的生理功能，可以增加外周組織對葡萄糖的利用，在治療1型糖尿病時，C肽與胰島素聯合使用，可以減少糖尿病的并發癥。
目前臨床還沒有C肽類似物補充，治療還是以針對改善胰島B細胞功能，給予外源性胰島素為主。