由于硼砂被水分所稀釋，毒性不高，因此輕微的皮膚觸碰或是短時間接觸，一般不會導致全身中毒反應，不必過于擔心。被接觸到的皮膚一般只有刺痛感，可以用大量清水長時間沖洗，以減少不適感，也可以多飲水，加速身體排出被皮膚吸收的毒素。
但長時間大量接觸硼砂水會對身體造成一定傷害，硼砂毒性較高，被世界各國禁用為食品添加物，人體若攝入過多的硼砂，會引發多臟器的蓄積性中毒。如果被接觸到的皮膚出現了皮疹、瘙癢等癥狀，屬于過敏反應，建議立即就醫，若出現嘔吐、腹瀉等全身中毒癥狀，建議立即去做全身檢查，等待醫生進一步判斷和治療。
硼砂水對金黃色葡萄球菌、結核分枝桿菌等細菌具有一定抑制作用，對真菌、病毒也有抑制效果，一般作為殺菌用品使用，但應該控制使用的量和次數，防止對人造成不必要的傷害。