牙髓摘除術屬于根管治療的其中一項內容，并且牙髓摘除術可以進行局部摘除，而根管治療通常需要全部摘除。所以牙髓摘除術與根管治療的區別，在于適用范圍不同、摘除范圍不同等。
1、適用范圍不同：牙髓摘除術以后可以進行塑化治療，不一定需要進行根管治療。但根管治療是在牙髓摘除術后，根管預備并進行根管充填。牙髓摘除術屬于根管治療的一個步驟，根管治療能比較徹底治療牙髓炎，以及牙體組織疾??；
2、摘除范圍不同：牙髓摘除術以后，不一定會對根管進行相應的預備，而且牙髓摘除術可以是部分摘除，也可以是全部摘除。根管治療是將牙髓徹底全部摘除去除，并且需要清創。不僅要將牙髓全部摘除，而且要將盛放牙髓的根管邊緣以及根管壁進行預備，將根管壁周圍進行擴管，擴成比較規則的形狀。