支原體肺炎三個月了還咳嗽，考慮是由支原體長期存在、炎癥介質釋放、免疫紊亂引起。建議及時前往醫院呼吸內科進行檢查，明確病因后，遵醫囑進行治療。
1、支原體長期存在：感染支原體后，能夠在呼吸道中長期存在，可以逃避黏膜纖毛的清除作用，造成支原體肺炎三個月了還咳嗽的情況；
2、炎癥介質釋放：在支原體肺炎的病程中，細胞和體液中產生的物質，能夠持續引起炎癥反應，出現支原體肺炎三個月了還咳嗽的現象；
3、免疫紊亂：由于支原體肺炎后，造成機體免疫功能發生紊亂，使得身體的免疫功能低下，無法完全抵抗支原體，導致支原體肺炎三個月了還咳嗽。
支原體肺炎三個月了還咳嗽，建議到醫院就診，在醫生的指導下使用藥物治療，如鹽酸左氧氟沙星片、阿奇霉素膠囊等，不可擅自減藥或停藥。在飲食上要攝入容易消化的食物，如豆腐、面片、南瓜等。