傳染性軟疣可以通過刮除、藥物治療等方式來治療，一般不疼。
1、刮除：在醫院消毒后，然后用刮勺將疣體全部刮掉，疣體內有白質，然后對整個瘡面消毒，等傷口自然恢復之后，就不會再感染了。如果是軟疣比較多的話，可以使用麻醉藥物，一般不會疼。
2、藥物治療：患者可以在醫生指導下使用咪喹莫特乳膏、維A酸乳膏等藥物進行治療，一般不疼，但見效會比較緩慢。