治療慢性結膜炎，必須先找出原因。若是環境刺激原引起的，則盡量減少接觸刺激源，如減少到公共場所（尤其是密閉室內）、減少接觸吸煙及燃燒廢棄物之煙灰。若是過敏原引起的，則避免接觸花粉、油漆、灰塵。若長期使用眼藥水或眼藥膏所引起的，可先停用眼藥一段時間，點用不含藥物及防腐劑之眼藥水（如生理食鹽水或人工淚液）；而以毛巾熱敷眼部（閉眼睛）一天三至四次，每次五至十分鐘，也是簡單易行而有效之方法。