睪丸畸形診治首先根據睪丸數目、位置及大小等的異常，結合影像學檢查可診斷。一般可以采用藥物治療或者同種異體睪丸移植術治療。
藥物治療：可使用絨毛膜促性腺激素與促性腺素釋放激素治療，雙側睪丸缺如可用性激素藥物替代治療，可以對矯正睪丸畸形癥狀起到良好作用。
同種異體睪丸移植術治療：取平行于腹股溝管斜切口，保留輸精管動脈，將睪丸置于陰囊皮下肉膜外間隙內，加以固定。從而使患者解除精神創傷，增強生活信心。