頭痛流涕需按病因治療，其常見因素有感冒、過敏性鼻炎和鼻竇炎。
頭痛流涕，若因受涼引起的，要注意加強休息，多喝水以增進機體代謝。若為細菌感染所致，可用阿莫西林膠囊和頭孢克肟分散片治療。若為病毒感染所致，可以服用更昔洛韋膠囊和阿昔洛韋膠囊。
鼻炎引起頭痛流涕，若因鼻腔黏膜腫脹致使分泌物排泄障礙所致，可用生理鹽水沖洗鼻腔，以促進鼻內分泌物的排泄，增強鼻腔通氣功能和減輕頭痛癥狀。
若為過敏因素引起，可予抗組胺類藥物有鹽酸西替利嗪片和氯雷他定膠囊。鼻竇炎會有更多膿性分泌物形成，使活動受阻，造成頭痛和流鼻涕，可遵醫(yī)囑服用甲硝唑片和替硝唑片。