口腔潰瘍的治療可以采用局部和全身兩種方法，以達到治愈的目的。
1、局部：對于局部的處理，主要采用止痛和散劑這兩種藥物。散劑用于緩解牙痛及牙齦炎引起的疼痛感，可將藥物溶于水中制成溶液服用。
為了緩解疼痛，醫生通常會使用達克羅寧或奴夫卡因作為止痛劑，這些藥物可以在每次餐前或疼痛時含漱，并在飯前含漱5-10分鐘，這樣可以有效減輕食物所帶來的刺激疼痛。
2、全身：對于全身治療而言，口服B族維生素是一種可行的選擇，而常用的復合維生素B片則能夠提高機體的修復能力，同時促進潰瘍的愈合。
同時還可以外用糖皮質激素軟膏和地塞米松乳膏。通常情況下，口服強的松片也是一種可行的激素治療方法。