女性沙眼衣原體感染是比較嚴重的，應及時進行治療。
沙眼衣原體可累及其他器官，如眼睛、生殖道等。如果是沙眼衣原體的攜帶者，沒有其他的臨床表現，那就說明不是很嚴重。但是，沙眼衣原體陽性是慢性傳染病，比如結膜炎，分泌物增多，如果不及時處理，就會導致高熱，而沙眼衣原體陽性則是比較嚴重的。