一般來說，男性生殖器真菌感染用抗菌藥。
如果是男性外陰真菌感染，可以使用抗菌藥物。最常見的是克霉唑膠囊和特比萘芬片，局部可用5%碳酸氫鈉外洗，也可以外用高錳酸鉀，也可以外用克霉唑軟膏、硝酸咪康唑軟膏。一般情況下，口服和外用的藥物都要使用4-6個星期。真菌的治療很難，需要很長的時間，需要持續的治療。如果局部瘙癢，也不能用手抓，否則會造成交叉感染。