目前治療軟疣的方法有藥物治療、疣體夾除、激光治療等，但是目前還沒有一種治療方法能夠徹底治愈。
其中液氮冷凍適用于數目少、體積大的疣體，冷凍治療對去除皮損有效，主要利用制冷劑產生低溫使病變組織壞死以達到治療的目的。治療后1～2天內可發生水皰，然后干燥、結痂，1～2周脫痂。