大多數時候支原體感染不是很嚴重。
由于支原體感染是自限性的，且經正規治療可達痊愈，如果為肺部支原體感染，可應用喹諾酮類藥物，主要有鹽酸左氧氟沙星膠囊、鹽酸環丙沙星片、諾氟沙星片等。在支原體肺炎的發病初期，患者的癥狀比較輕微，采用上述藥物進行治療能夠有效的縮短病程且預后較好。