一般情況下，兒童腎病綜合征病因及發病機制目前尚不明確。
1、免疫系統異常：免疫力低，包括細胞免疫、體液免疫和補體，補體低是腎病綜合征癥狀也是發病原因之一。2、兒童繼發性腎病綜合征：主要是由于全身性疾病、臨床診斷明確的腎小球腎炎以及藥物、金屬中毒等原因引起腎臟損害而出現腎病綜合征。3、感染：免疫系統異常導致免疫力下降，細菌、病毒、支原體甚至真菌、寄生蟲等趁虛而入，導致感染。