新生兒巨細胞病毒感染有宮內感染、圍產期的感染兩種。
1、宮內感染，即母親在子宮中感染了巨細胞病毒，這種胎兒有可能會流產，也有可能是死胎。新生兒也有可能會出現神經功能方面的問題，或者是神經系統受到了傷害。
2、圍產期的感染，這是由于圍產期的宮頸、產道的逆行感染所致，有些孩子不會表現出明顯的臨床表現，有的孩子會出現呼吸系統和肝臟的損傷。