巧克力囊腫懷孕初期是會腹痛。巧克力囊腫又名卵巢子宮內膜異位囊腫，是子宮內膜異位癥的一種。一般子宮內膜生長在子宮內，但是在月經期的時候由于子宮內膜的脫落，經血可能逆流，比如在經期發生性行為，可能會導致經血逆流到輸卵管進入盆腔，進而種植在卵巢表面或者是盆腔其他部位，形成異位囊腫。