手術拔甲：在局部麻醉下，將患甲拔除。這種方法創面大，出血，易引起感染。手術后一般會感覺較疼痛，由于“治標不治本”，一般不太理想，容易重新感染復發。而且心臟病、高血壓、糖尿病等的患者，不宜手術治療。內服藥物：單純服用抗真菌藥物如灰黃霉素、氟康唑、伊曲康唑等，有一定療效，且方便。但因為這類藥必須達到真菌所寄生的甲板處才能發揮抗菌作用，而且在水中的溶解度低且慢，吸收代謝又很快，所以用藥量大，用藥時間長。另外，口服藥均有副作用，且停藥后易復發，故不宜作為灰指甲的常規治療藥物。