藥物治療是目前臨床治療乳腺增生的主要手段，患者需明確病因后，在醫生指導下用藥。
西藥治療主要是使用維生素類的藥物，有維生素B6、維生素E，然后補充必需的脂肪酸以及運用調節內分泌的藥物，如三苯氧胺、托瑞米芬等。同時也可選用中成藥來進行治療，例如乳結泰膠囊，該藥具有疏肝理氣，化痰散結，活血止痛的功效，可用于治療因肝郁氣滯，痰凝血瘀所致乳腺增生、乳腺結節等疾病問題，可改善患者乳房脹痛、觸痛，縮小乳房腫塊。
除用藥外，乳腺增生患者還需保持良好的飲食習慣，攝入足夠的蔬菜、水果和纖維素，限制咖啡因和酒精的攝入，也可適當運動，有助于改善血液循環和緩解乳腺增生癥狀。