一般來說，腦缺血灶和腔隙性腦梗死的原因如下：
腦缺血灶和腔隙性腦梗死可能是因為年齡的原因，或者是因為疾病引起的。年齡的增加會使血管逐漸硬化，小血管閉塞，出現局部壞死、吸收，形成小的軟化灶，這就是所謂的缺血灶或者腔隙性腦梗死。糖尿病、高血脂癥會加速動脈硬化，從而導致缺血灶。另外，如果出現心源性的栓子脫落，發生了血栓，那么可能會發生腔隙性的腦梗塞。