心尖肥厚型心肌病晚期也應積極進行相關檢查和治療，積極治療原發性疾病。
高血壓病引起心尖肥厚型心肌病，應積極降壓，繼飲酒之后心尖肥厚型心肌病，應遠離煙酒。一般晚期這類疾病，需要嚴密觀察患者病情，確認是否存在心力衰竭，根據病情進行強心治療。另外，也可以服用硝酸酯類藥物，以擴張血管或給予利尿劑進行治療，這些藥物應該在醫生的指導下使用。