早上醒來后咳嗽的原因有很多種，可能與病毒感染、細菌感染、氣道高反應或者上氣道咳嗽綜合征等相關，所以針對不同的原因，需要采取不同的處理方式。
1.病毒感染：病毒感染是常見的早上咳嗽的原因。特別是上呼吸道感染，通常與病毒感染有關，具有一定的自限性。在咳嗽癥狀不嚴重時，可以暫時觀察，但如果咳嗽明顯，可以服用止咳藥物，如止咳糖漿或小兒咳喘靈泡騰片進行治療。
2.細菌感染：細菌感染也可能導致早上咳嗽。若為這種情況，建議服用抗生素進行治療，如阿莫西林或頭孢克洛。但請務必在醫生指導下使用，避免自行選擇藥物。
3.氣道高反應：氣道高反應也可能導致早上咳嗽。這些情況通常表現為干咳，建議采用霧化藥物進行治療，如硫酸特布他林霧化液。對于嚴重咳嗽的病例，建議聯合霧化糖皮質激素，如吸入用布地奈德混懸液。此外，對于上氣道咳嗽綜合征，應考慮治療鼻炎、鼻竇炎等上氣道疾病，及時清洗鼻腔，保持鼻腔通暢。