巧克力囊腫不是不孕不育。
巧克力囊腫屬于子宮內膜異位癥的一種表現，并不屬于不孕癥，但是由于子宮內膜異位癥會在一定程度上影響卵母細胞質量、輸卵管蠕動，盆腔內外環境等受孕因素，所以很有可能導致女性受孕困難，因此建議患者要及早治療，做好充足的受孕準備。
建議要注意身體保暖，避免劇烈運動，減少性生活的次數。飲食上多吃富含營養的蔬菜水果，如菠菜、山藥、白菜、牛奶等等。