支原體肺炎有自愈性。
支原體肺炎有自限性，多數輕癥患者不經治療可自愈。早期使用適當抗生素可減輕癥狀及縮短病程，常有藥物有大環內酯類抗生素、氟喹諾酮類、四環素類。嚴重者可能需要應用糖皮質激素、丙種球蛋白。必要時，還可通過支氣管鏡進行治療。
患者不要吃辛辣刺激性食物，限制飲酒。