連花清瘟對甲流引起的發熱、頭痛等癥具有較好的治療效果，甲流患者是可以服用的。
甲型流行性感冒是一種由甲型流感病毒引起的急性呼吸道傳染病，其臨床主要表現為發熱或高熱，伴隨明顯的頭痛、乏力、肌肉酸痛等全身癥狀，以及咽干咽痛、鼻塞流涕等呼吸道癥狀。中醫稱甲型流感為時行感冒，認為其屬于“時疫、溫病”的范疇，病機為邪熱蘊肺，衛氣被郁，所以導致患者出現發熱、頭痛等癥狀。
連花清瘟膠囊的組方融匯了三朝名醫治療疫證的用藥精華，以漢代張仲景《傷寒論》麻杏石甘湯清瀉肺熱、清代吳鞠通《溫病條辨》銀翹散疏散外邪、明代吳又可《溫疫論》治疫證用大黃經驗通腑泄熱經驗；創新性的加入紅景天清肺化瘀，調節免疫，顧護正氣，可以較好地祛邪、扶正，改善流感引發的發熱、頭痛等癥狀。