腱鞘炎囊腫切除并發癥有神經損傷或者出血。
在手術過程中可能會引起神經出現永久性損傷，從而會導致正常的肢體功能減退，容易出現肢體麻木或者屈伸不利，部分人群會出現手術后出血或者麻醉意外，對麻醉劑過敏人群容易出現休克或者死亡，并且有復發的可能性。在手術期間做好預防工作，能夠降低并發癥發病概率。
在手術后要密切觀察自身的狀況，手術部位出現了紅腫或者流膿的情況，需要到醫院做進一步的檢查，在醫生的指導下進行傷口的清理。