紅霉素軟膏主要是用來治療細菌感染的，并且紅霉素軟膏也可以用來預防細菌感染。而相應的，皰疹則是由于皰疹病毒感染造成的，治療此類疾病通常需要使用核苷類的抗病毒藥物，因此如果使用紅霉素軟膏的話是不對癥的，不建議使用紅霉素軟膏治療皰疹。治療皰疹病毒常見的藥物有阿昔洛韋、泛昔洛韋以及伐昔洛韋等，但是建議患者在用藥之前應當經過醫生詳細的診斷，不建議自行用藥。但是如果患者的皰疹病毒感染合并有細菌等的感染的話，是可以使用紅霉素軟膏的。