寶寶發燒搖頭有可能是起丘疹、顱內感染等原因引起的，需要對癥治療。
1、起丘疹：由于寶寶在戶外活動時容易出汗，如果不注意清潔，就會在皮膚上長出丘疹，這些丘疹會引起寶寶的瘙癢，如果寶寶的手抓撓丘疹，就會造成寶寶發燒時搖頭的現象。可以口服丹皮酚軟膏、爐甘石洗劑等。
2、顱內感染：有可能是由于細菌或者病毒感染導致的，當寶寶的腦部出現反復發熱、搖頭、拍打腦袋、惡心嘔吐等癥狀時，就有可能是腦部感染，由于腦部的炎癥，寶寶才會搖頭，建議去醫院做進一步的檢查。
建議及時就醫，以免延誤病情。