革蘭氏陰性菌是導致醫院內感染的主要致病菌，它們的存在給患者帶來了極大的危害。
近年來由于抗生素大量使用以及各種侵入性診療技術的應用，導致了院內感染發病率增高，尤其是老年病人增多，其原因除與抗菌藥物濫用有關外，更重要的是老年人免疫力低下所致。
醫院內的病原體種類繁多，包括細菌、真菌、病毒、原蟲和立克次體等，其中細菌和真菌是最常見的，而院內感染則是指患者或醫院工作人員在醫院內感染的情況。其中以革蘭氏陰性桿菌為主，其次為金葡菌屬及不動桿菌等其他微生物。
革蘭氏陰性菌是細菌的主要代表，其中大腸埃希菌、肺炎克雷伯菌和沙門氏菌等屬于腸桿菌類的細菌尤為突出。真菌則為白色假絲酵母菌及熱帶酵母屬中的許多種類。念珠菌是真菌中較為普遍的一種。另外還有一些非典型病原菌也可導致院內感染。
院內感染的傳播途徑主要涉及接觸、血液、醫療器械和空氣飛沫等多種途徑。加強醫院內環境管理及控制交叉感染尤為重要。