會厭囊腫不做手術后果主要是可能會出現囊性腫物，給后期治療增加難度。
會厭囊腫一般是由于會厭黏膜的黏液腺管阻塞所致，主要的臨床癥狀就是有咽部不適、呼吸不暢、喘鳴等。通常會厭囊腫比較小，可以進行跟蹤觀察，但是會厭囊腫比較大，就必須進行囊腫切除術、低溫等離子消融術等手術治療。如果再不做手術，會厭囊腫就會不斷擴大，黏液滯留在會厭囊腫周圍，會讓會厭囊腫變得更加難以治療。
另外，由于囊性腫物堵塞了聲門，也會導致呼吸困難，嚴重時還會出現窒息等情況，對人體健康造成很大的影響。