根據你描述的這種情況來看，你現在出現這種發熱以及腹瀉的現象是急性的腸炎的癥狀，對于渾身乏力肌肉酸痛有可能是腸炎身體體質差并且你這軍訓期間過度的勞累引起的這種表現。
給你的建議就是首先這幾天要適當的注意好休息避免過度的疲勞和勞累在飲食上一定要注意，盡量的避免吃一些不衛生的和寒涼的食物，適當地應用一些諾氟沙星，和消炎藥和環丙沙星片，都有一定的調理和緩解的作用。