在臨床實踐中，通常取尿道分泌物進行支原體培養藥敏試驗，根據檢查結果選擇敏感藥物進行系統治療。臨床實踐中常用的典型藥物包括多西環素，米諾環素，鹽酸四環素。第二類是大環內酯類藥物，代表藥物有阿奇霉素、紅霉素、羅紅霉素、克拉霉素等。第三類是代表性喹諾酮類，包括環丙沙星、鹽酸左氧氟沙星等。以上是治療支原體感染的最佳藥物。