藏毛竇可以通過手術治療。
藏毛竇的治療以外科為主。若無明顯的局部感染，應將全部炎癥組織和竇道全部切除，直至骶筋膜。藏毛竇周圍有大量的炎癥，在盡量清除炎癥組織后，應充分開放傷口，待局部感染得到控制后再進行二期手術。對于大面積壞死組織切除的病人，在二期手術中需要進行局部移植或游離皮瓣，以徹底修補皮膚缺損。