中醫學認為，濕熱腹瀉屬于濕熱型泄瀉、痢疾等范疇，因此在臨床實踐中，可以采用葛根、黃芩等中草藥，以及葛根芩連湯、芍藥湯等方劑，同時也可以使用甘露消毒丸、復方黃連素片等中成藥。
1、中草藥：針對濕熱腹瀉的癥狀，可選用葛根、黃芩、黃連、薏苡仁、厚樸、金銀花、芍藥、連翹、薄荷等多種中草藥，這些草藥均具有一定的清熱燥濕功效；
2、方劑：治療急性腸炎、細菌性痢疾等疾病時，葛根芩連湯是一種具有解表清里功效的常用方藥，其主治協熱下利，可有效緩解癥狀。芍藥湯，作為一種清熱劑，能夠有效地清除內臟的熱氣，清除體內的熱燥濕，調節氣血平衡，因此在臨床上被廣泛應用于治療濕熱痢疾；
3、中成藥：甘露消毒丸，一種中成藥，以其具有的芳香化濁度和清熱解毒的功效而著稱。四妙勇安湯具有清利濕熱，涼血止血的功效。復方黃連素片所具備的功效包括清除體內熱毒濕邪、促進氣血暢通、緩解腹瀉和腹瀉等癥狀。黃連解毒湯有清瘟敗毒之功，白頭翁散具有清腸瀉火、涼血止血之功效。藿香正氣丸所具備的功效，在于其能夠有效地解除表淺的濕氣，促進氣血的平衡和協調。治療濕熱型泄瀉、痢疾的藥物均可采用上述藥品。
除了藥物治療，患者還需注意日常飲食的調節，以清淡為主，避免食用過于刺激、辛辣的食物，如辣椒、燒烤等，同時還需避免煙酒的攝入。