左側卵巢囊腫是否會影響生育，需要根據囊腫是否會影響卵巢排卵決定。
如果是單純性卵巢囊腫不超過5cm，那么在來例假后就會自行消退，不會對排卵造成任何的影響。卵巢巧克力囊腫、囊腫比較大，沒有正常的卵巢組織，會影響到卵巢的排卵，從而影響到生育。另外，卵巢巧克力囊腫屬于子宮內膜異位癥，會引起輸卵管粘連、盆腔粘連，從而影響輸卵管輸送精子和卵子，從而引起不孕或宮外孕。